1、“985工程”一期建设率先在北京大学和清华大学开始实施。2004年，根据《2003—2007年教育振兴行动计划》，教育部、财政部印发《教育部、财政部关于继续实施“985工程”建设项目的意见》，启动二期建设。
2、“985工程”建设任务为机制创新、队伍建设、平台建设、条件支撑和国际交流与合作等五个方面；采取国家、共建部门和高等学校三级管理方式，以高等学校自我管理为主；建设实行项目管理和绩效考评。
3、“211工程”建设的主要内容包括学校整体条件、重点学科和高等教育公共服务体系建设三大部分；建设项目均实行项目法人责任制、招投标制和工程监理制；各“211工程”学校成立项目法人组织和落实项目法人代表，有关省（区）主管部门成立“211工程”建设领导小组，形成中央、省（区）和学校三级管理体制。