1、本州 (本岛)
231,000 平方公里
2、北海道 (位于日本北方的岛屿)
83,000 平方公里
3、九州 (位于日本南端的岛屿)
42,000 平方公里
4、四国岛
19,000 平方公里
5、择捉岛（俄控制着，日俄争议）,北方四岛中最大的岛屿
3182.65平方千米
6、国后岛(俄控制着，日俄争议)，北方四岛第二大岛
1498.56平方千米
7、得抚岛（俄控制着，日俄争议）
1400平方公里，位于北海道东北，择捉岛附近。
8、冲绳岛
面积1182.5平方公里，日本九州南部冲绳诸岛的主岛，位琉球群岛中央，群岛中最大岛屿。 长106公里，最宽处31公里。。人口约94万。北部为山地。
9、佐渡岛，位于本州岛以西的日本海
面积857平方公里。人口8.8万。
10、奄美大岛
面积709平方公里(274平方哩)，日本鹿儿岛县岛屿。是琉球群岛北部奄美群岛中最大的岛屿。多山地和森林
11、淡路岛
面积593平方公里
日本濑户内海中最大岛屿。北为明石海峡，东为纪淡海峡，西南为鸣门海峡，南为纪伊水道，西临播磨滩。，包括所属小岛共596.4平方公里。人口17万
12、下岛
面积574平方公里，位于日本九州岛西部，长崎市南部，是天草群岛中最大的岛屿
13、其它大岛还有如种子岛（500平方公里左右），屋久岛（501平方公里），对马群岛等。