师资上面的差别：
公办院校与民办的区别还在于师资上面的不同，公办院校的师资一般要比民办的好，而且好很多，这点是由于其学校性质所决定的。
公办可以享受的师资待遇与民办的自聘自费是有很本质的区别，也是很多家长所顾忌和顾虑到的，就目前的情况来说，民办的师资短板已经在渐渐的缩短了。
社会大众的看法：
民办的本科，大部分是三本院校，好一些的是二本院校；一般来说，民办的学生在高考时成绩的不算太好。在毕业时虽然同是本科学历，都拥有学士学位，但是这难免会有一些人的有色对待，这点在现实中是比较常见的。
组织不同：
公办大学，是指由国家举办的学校，其办学经费全部来自国家财政拨款。而民办高校是指企业事业组织、社会团体及其他社会组织和公民个人利用非国家财政性教育经费，面向社会举办高等学校。