一分子氨基酸的α-氨基与另一分子氨基酸的α-羧基脱水缩合形成的共价键称为肽键。两分子氨基酸缩合成为二肽，二肽仍有自由α-氨基和α-羧基，能同样通过肽键与其他氨基酸缩合成三肽，相同的反应可继续进行，依次形成四肽、五肽……通常由10个以内氨基酸连成的肽称为寡肽，更多的氨基酸可连成多肽，氨基酸相互连接，形成长链，称为多肽链。
二硫键性质
二硫键结合能力较强，典型的二硫键键离解能为60kcal/mol(251kJ/mol)。由于二硫键比C-C键和C-H键弱40%左右，在许多分子中二硫键往往是”弱键”。此外，S-S键反映了二价硫的极化特性，容易被极性试剂（包括亲电试剂和亲核试剂，特别是亲核试剂）切断。
二硫键的长度约为2.05A，比C-C键长约0.5A。绕S-S轴旋转的势垒较低。二硫化物对接近90°的二面角有明显的偏好。当角度接近0°或180°时，二硫化物是一种更好的氧化剂。两个R基团相同的二硫化物称为对称二硫化物的，例如二苯二硫和二甲基二硫。当两个R基团不完全相同时，该化合物被称为不对称或混合二硫化物。