重庆工商大学源出两脉，一脉为1952年创办的重庆机电工业学校，历经重庆机器工业学校、第一机械工业部重庆机器制造学校、重庆第二机器制造工业学校、重庆第二机械工业学校、渝州大学等发展阶段。一脉为1963年创办的重庆财贸干部学校，历经重庆财贸学校、重庆商学院等发展阶段。2002年两脉合并组建重庆工商大学。
学校现有应用经济学、工商管理2个市级“一流学科”，10个市级重点学科。在第四轮学科评估中，共6个学科上榜，其中应用经济学、工商管理2个学科获B-等级，4个学科排名市属高校第一。根据2018软科“中国最好学科”排名，学校8个学科上榜。其中，应用经济学、工商管理排位前25%。